ارکان مرکز عبارتند از:
الف – شورای عالی
ب – رئیس مرکز
اعضاء شورای عالی مرکز عبارتند از:
1) رئیس دانشگاه علوم پزشکی و خدمات بهداشتی درمانی
2) معاون پژوهشی دانشگاه علوم پزشکی و خدمات بهداشتی درمانی
3) معاون امور بهداشتی دانشگاه علوم پزشکی و خدمات بهداشتی درمانی
4) رئیس مرکز
5) سه نفر از اعضاء هیات علمی مرکز با پیشنهاد رئیس مرکز و تائید رئیس دانشگاه
وظایف شورای عالی مرکز بشرح زیر می باشد:
1) تصویب خط مشی پژوهشی مرکز
2) تصویب طرحهای همکاری با سایر دانشگاه ها و موسسات آموزشی پژوهشی داخلی و خارج از کشور و سازمانهای بین المللی مطابق مقررات و ضوابط مربوطه
3) بررسی و تصویب گزارش سالانه فعالیتهای مرکز
4) بررسی و تصویب و بودجه سالانه مرکز درمحدوده اعتبارات تخصیصی و با رعایت ضوابط قانونی
5) تصویب دستورالعمل های مربوط به امور داخلی شورای عالی و دستورالعمل های اجرائی مرکز تحقیقات
6) پیشنهاد سازمان و تشکیلات مرکز
وظایف رئیس مرکز:
رئیس مرکز بالاترین مقام اجرائی مرکز است و در حدود ضوابط قانونی و مصوبات شورای عالی جهت اجرای وظایف و امور محوله اقدام می نماید.